Month: May 2022

OSM(發音為令人敬畏)硬件在空間中進行DNA

OSM代表專為微皰疹使用的寡核苷酸合成器,這意味著它是在空間中進行任意DNA鏈(中等長度)的裝置。令人驚嘆的呃?在過去的八個月裡,我一直在這個項目,這是一個美妙的沙客團隊,作為斯坦福學生空間倡議的一部分,我想分享我們正在做的事情,我們已經完成了什麼,以及我們要去的地方。 為什麼空間?好吧,首先,空間很酷。但更嚴重的是,在太空中獲得任意DNA可以加速在血清域內的研究,以及轉基因工程群體生產物質的能力(在火星殖民地上發言)可能意味著死亡和救生射擊之間的差異。簡而言之,很難預測,確切的DNA可能需要在手之前進行研究或實際使用。 首先,隨著哈帕迪在生物學術語上有點輕,我們需要在潤滑溝通方式的方式下獲得一點詞彙。如果你有博士學位。在合成生物學中,您可能希望跳過本節。否則,這裡有五個快速的術語,使你的大腦更大如此留在我身邊! 脫氧核糖核酸(DNA) 由於DNA是該項目的重點,因此在進行之前,可以理解DNA是至關重要的。但是,由於大多數人在高中生物學課程中看到DNA,我將保持簡潔簡單。 首先,DNA是由核苷酸組成的聚合物。核苷酸是DNA的結構塊,由四種核鹼基 – 胞嘧啶(C),鳥嘌呤(G),腺嘌呤(A)或胸腺嘧啶(T) – 一種稱為脫氧和磷酸鹽基團的結構塊。不同的核苷酸可以在不同的核苷酸分子結合到不同的DNA上的相應核苷酸(a至t; c至g)。如果DNA股線上的鹼是鹼對另一鏈的鹼基,則兩種聚合物可以結合併形成雙鏈DNA。還有一個注:DNA有兩種不同的目的:三個素數(3’)末端和五個主要端(5’)。 寡核苷酸(AH-LI-GO-NEW-KLEE-O-ride) 寡核苷酸是短的DNA或RNA分子,並且在一般研究,遺傳檢測和生物工程中非常有用。寡核苷酸的長度(寡核苷酸短)通常在具有30個鹼基的寡核苷酸的情況下表示為30-MER或D30。一股DNA是否必須被認為是寡核苷酸的短暫?好吧,當我們……讓我們在DNA合成中說不那麼擅長,寡核苷酸牢固地在2-50範圍內。然而,隨著磷酰亞胺石的出現(無機DNA合成方法),寡核苷酸的長度可以為2-1000 +鹼基。 均聚物 僅包含一種類型的鹼(例如與AgTctG而不是AAAAAA)包含的寡核苷酸稱為均聚物。 末端脫氧核苷酸轉移酶(TDT) 末端脫氧核苷酸轉移酶,通常縮寫為TDT,是當滿足某些條件時,可以將任意核苷酸添加到DNA鏈的3’末端的聚合酶樣酶。 TDT可以附加所有四個核苷酸,但表明對鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)的偏好。 TDT可以在不成熟的,前B和Pre-T淋巴結細胞中發現,它通過將鹼添加到我們DNA的3’(三種Prime)末端來對我們的免疫系統進行遺傳多樣化。 Sybr Green I. SYBR(Deach Cyber​​)是與形成DNA-染料的DNA結合的分子,其吸收藍光並發射綠光。此外,SYBR優先與雙鏈DNA結合,但將單鏈DNA結合至較小程度。 在太空中製作DNA的目標 既然我們正在談論相同的語言,讓我們看一下酶促在空間中進行任意DNA的目標。究竟是什麼意思,為什麼空間?好的,讓我們拿這個單詞: 任意:我們的進程不應該簡單地製作DNA的副本(如PCR),而是應該改為創建一個可以鍵入計算機(並且可以物理存在)的任何序列(例如AGCTATC)。 DNA:我認為你們都有這個 在太空中:顯而易見的含義:我們希望我們的最終設備在太空中工作,這施加了各種各樣的物理和化學限制。 酶促:我們希望使用酶代替危險和資源強化磷酰胺方法使用新的DNA合成方法。 添加了在微匍匐的微生物中製造自定義DNA的能力可能意味著我們在遠離地球的能力方面的大幅前進。 OSM作為生物攻擊者的工具包,我們將在新環境中面對新環境,當我們支持其他行星。 總之,我們希望以一種新的基於酶的方法在苛刻的環境中創建可定義的寡核苷酸。他們說將你的目標設置為高,對吧? 最低可行的產品(MVP) 好的,也許不是那麼高。至少,不是最初的。我們選擇採取迭代方法而不是全部跳躍。現在,我們正在努力推出“可靠的產品”一些原因: 迄今為止驗證我們的工作 對空間準備設計變得舒適 獲取真實空間數據 獲得未來發射的可信度 MVP過程 因為這是我們的最小可行的產品,我們的整體目標是一口小叮咬。因此,我們的MVP將在現有的寡核苷酸結束時合成均聚物,而不是創造完全任意的DNA。我們不會完全控制其序列(遍布好時機),但我們將展示我們一些工作的概念證明。 首先,我們將從溶液中開始以均聚物腺嘌呤(A)DNA鏈。一旦空間,我們將提高溫度並允許TDT將胸腺嘧啶(T)施加到股線上。 因為胸腺嘧啶(t)和腺嘌呤(a)是互補的,所以單鏈DNA應形成雙鏈DNA。 然後,我們將使用Sybr Green I來發現如果解決方案中有雙鏈DNA,以確定我們的實驗是否有效。這是作用的,因為SYBR優先與雙鏈DNA結合,並且如果與DNA結合,則只能熒光。這個驗證步驟非常重要,因為我們將無人駕齊況,而且沒有驗證的科學並不是真正的科學。 此外,髮夾DNA或更正式的莖 – 環狀分子內鹼基配對,是這種設計的可能性。如果DNA自身結合,它不能與其他股線結合。聽起來像是一個問題,對吧?但是仔細觀察:如果DNA本身綁定。即使我們形成髮夾而不是“適當的”雙鏈DNA,我們仍然會有雙鏈DNA,我們可以檢測。 在審查中,我們使用其目的是Sybr Green I的遺傳多樣化的酶,該分子通常用於電泳中使用的染色凝膠,以在空間中合成DNA。 現在,雖然這聽起來很簡單,但合成生物學總是聽起來很簡單。然而,在我的生物體驗中,沒有什麼是簡單的。需要各種數據,因此我們可以自信我們的設備將工作。我們到目前為止我們做了什麼: 髮夾活力數據…

By ojn May 27, 2022 0

Sparkfun的自動汽車競爭

[保羅品種]參加了今年的自治車競賽,由Sparkfun Electronics舉辦。與許多項目一樣,截止日期真的偷偷摸摸地抓住了他,他最終在比賽前塞進了一堆代碼開發。他的經歷是在這個最近的博客帖子中共享的。 硬件的一個大部分是用於牆面的激光測距儀。在休息後的視頻中,這在視頻中進行了很好地解釋,但您可以在上面的圖像中看到側向藍色框。 [保羅]還花了很多時間為汽車需要穿過紅色箍的課程的檢查部分。在學習之前,他在圖像處理設置上工作了很長時間,在圖像處理設置上找到並導航這些箍,並且在已知的位置定位,並且在完成挑戰之後使用路徑將更容易更容易。 他沿途有幾個豬肉。在調試汽車期間的一點 – 通過以太網連接到他的筆記本電腦 – 它遠離他。這將NIC理想從他的電腦背面撕開。在活動的當天,他有一些低電量問題,可以摧毀他的激光校準。但是[保羅]用拳打滾動,結束了聲音,就像一個參加比賽的真正令人興奮的經歷。

By ojn May 25, 2022 0

電動自行車(不包括耳塞)

這是顯而易見的這輛自行車有一些額外的零件。但仔細觀察,你會看到鏈條沒有鏈接到它。考慮到[PJ Allen]重新排隊,踩踏會讓您無法使用電動機駕駛這款自行車。 他得到了良好的電機,在24伏特下拉350瓦特。對於速度控制,他選擇使用Arduino,將PWM信號泵出來給一些MOSFET。這導致了一個非常嘈雜的設置,因為您可以在休息後在板凳測試視頻中聽到。但是,一旦它安裝在自行車上,它根本不會安靜下來。你可以聽到一塊街區。 當試圖從靜止開始電動機時,原始道路測試第一套7A MOSFET。聽起來他選擇了40A的替代品。我們沒有看到有關電池壽命的任何信息,但如果他在鎮的另一邊用完果汁,我們打賭他會希望他留下了連接到曲柄的鏈條。

By ojn May 21, 2022 0

鵝莓是最近的ARM Linux板

看起來我們終於看到了單板電腦的擴散起飛。最近被稱為醋栗。雖然它會在發佈時花費約40美元/ $ 62美元,但它極大地優於目前的小型Linux板。 作為最新的最近一條長線的這些手臂式的單板電腦,鵝莓很大程度上優於通過APC和Raspberry PI,並使用以1.2GHz,512 MB的RAM運行的Allwinner A10 CPU,以及內置WiFi 。基本上,鵝莓擁有您希望的所有功能,您將期待Android平板電腦;這是因為這是因為鵝莓實際上是在少數中國平板電腦中發現的。 有一些非常好的功能,如LVDS輸出,可以在不介入HDMI輸出的情況下添加LCD顯示器,並且表單元素非常薄,使其成為構建小型便攜式設備的理想選擇。 休息後,您可以查看醋栗板的演練以及運行Ubuntu的證據。

By ojn May 18, 2022 0

對於Apple II

不想躺在他的Apple II戰鬥中的眾多磁盤,[下一步]開始調查硬盤解決方案的眾多磁盤。有舊時間服務 – 最初為Apple ///和Lisa開發的簡檔硬盤,但這些是母雞的牙齒不尋常,並且與新的緊湊型閃光適配器一樣昂貴。 [下一步]另外選擇 – SCSI,帶有適配卡,但時代的許多SCSI小工具都沒有塑造AII外圍設備的酷“可堆疊”美學。 使用一點邦德和一些塗料,[下一步]將舊雙磁盤驅動器發出舊雙磁盤驅動器,這是一個完美的複古的硬盤,非常適合存放和運行眾多舊遊戲。 [下一步]通過拍攝舊的Apple Duodisk(上面看到的兩盤驅動器)開始他的構建並在前面的洞上綁定。在Apple標識上方添加了驅動活動燈,舊驅動器保存了另一天。在新的機箱內,在Macintosh SE / 30上評估的舊40MB硬盤驅動器安裝在一起,以及驅動器的小電源。使用一些定制的SCSI電纜,驅動器將為它的盛開首次亮相準備。我們認為它看起來令人難以置信,只是坐在那裡,並肯定是[接下來]系列的驕傲。

By ojn May 10, 2022 0